MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 chromosome

Total Repeats: 6289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_013851	CGG	2	6	3321303	3321308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_013851	CG	3	6	3321701	3321706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6003	NC_013851	CAT	2	6	3321738	3321743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_013851	GCC	2	6	3321772	3321777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6005	NC_013851	GCAC	2	8	3321788	3321795	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6006	NC_013851	ACG	2	6	3321804	3321809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_013851	CT	3	6	3323235	3323240	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6008	NC_013851	ACGG	2	8	3323261	3323268	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6009	NC_013851	CT	3	6	3323389	3323394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6010	NC_013851	ACA	2	6	3325203	3325208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_013851	CCG	2	6	3325213	3325218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6012	NC_013851	GCC	2	6	3325231	3325236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6013	NC_013851	TTGG	2	8	3325240	3325247	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_013851	GCC	2	6	3325313	3325318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6015	NC_013851	ACG	2	6	3327190	3327195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_013851	CGG	2	6	3327271	3327276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_013851	T	6	6	3327721	3327726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_013851	GTC	2	6	3327770	3327775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_013851	GATG	2	8	3327801	3327808	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_013851	CGGC	2	8	3327817	3327824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6021	NC_013851	CAACG	2	10	3327911	3327920	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6022	NC_013851	CG	3	6	3327930	3327935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6023	NC_013851	ACC	2	6	3328013	3328018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6024	NC_013851	GC	3	6	3328020	3328025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6025	NC_013851	ACC	2	6	3328027	3328032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6026	NC_013851	T	6	6	3329922	3329927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6029	NC_013851	C	6	6	3344891	3344896	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6030	NC_013851	CAT	2	6	3344991	3344996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_013851	CGG	2	6	3345046	3345051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_013851	GC	4	8	3345061	3345068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6033	NC_013851	CGG	2	6	3347235	3347240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6035	NC_013851	CGAA	2	8	3347310	3347317	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6036	NC_013851	GGA	2	6	3347353	3347358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_013851	GCG	2	6	3347372	3347377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_013851	CGG	2	6	3347475	3347480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_013851	GCCGAC	2	12	3347537	3347548	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6040	NC_013851	GAGC	2	8	3347554	3347561	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6041	NC_013851	CAG	2	6	3347565	3347570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_013851	GTA	2	6	3347576	3347581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_013851	GAA	2	6	3347612	3347617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_013851	GTG	2	6	3349039	3349044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6047	NC_013851	CAT	2	6	3349168	3349173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_013851	TCA	2	6	3349181	3349186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6051	NC_013851	GCG	2	6	3349470	3349475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_013851	AG	3	6	3352581	3352586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_013851	CGC	2	6	3353805	3353810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6054	NC_013851	GTCCC	2	10	3353861	3353870	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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6056	NC_013851	T	6	6	3353973	3353978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6058	NC_013851	A	8	8	3354036	3354043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_013851	A	6	6	3354063	3354068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_013851	T	6	6	3354077	3354082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_013851	CCCTT	2	10	3354127	3354136	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
6062	NC_013851	CAA	2	6	3354147	3354152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_013851	ACA	2	6	3354194	3354199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_013851	CCATG	2	10	3354245	3354254	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6065	NC_013851	TGC	2	6	3354265	3354270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_013851	GCG	2	6	3354351	3354356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_013851	GCGA	2	8	3354957	3354964	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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6069	NC_013851	TAG	2	6	3355016	3355021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_013851	GT	3	6	3358222	3358227	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6075	NC_013851	GC	3	6	3361495	3361500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6076	NC_013851	GGT	2	6	3361913	3361918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6079	NC_013851	GTC	2	6	3363295	3363300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6089	NC_013851	ATGA	2	8	3374088	3374095	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6095	NC_013851	CG	4	8	3381327	3381334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6096	NC_013851	GCCG	2	8	3384447	3384454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6097	NC_013851	GGCA	2	8	3384463	3384470	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6098	NC_013851	GGAC	2	8	3384514	3384521	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6099	NC_013851	CGG	2	6	3384534	3384539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_013851	GGCC	2	8	3386543	3386550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6101	NC_013851	GC	3	6	3386609	3386614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6102	NC_013851	ATG	2	6	3386639	3386644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6106	NC_013851	T	6	6	3386935	3386940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_013851	TC	3	6	3388214	3388219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6108	NC_013851	CGG	2	6	3388220	3388225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_013851	TCGGG	2	10	3388249	3388258	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6110	NC_013851	GCGA	2	8	3388266	3388273	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6111	NC_013851	GTC	2	6	3394869	3394874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_013851	CGAC	2	8	3394876	3394883	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6113	NC_013851	CGCC	2	8	3399306	3399313	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6114	NC_013851	A	6	6	3399333	3399338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_013851	TCG	2	6	3399357	3399362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6123	NC_013851	ATG	2	6	3399597	3399602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6126	NC_013851	CG	3	6	3399649	3399654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6127	NC_013851	CGA	2	6	3400170	3400175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6129	NC_013851	CCGAG	2	10	3401514	3401523	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6130	NC_013851	GAT	2	6	3401557	3401562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6132	NC_013851	CGG	2	6	3401625	3401630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6133	NC_013851	CGCA	2	8	3401640	3401647	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6134	NC_013851	GCA	2	6	3401724	3401729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6135	NC_013851	GCT	2	6	3401804	3401809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6136	NC_013851	TAT	2	6	3401818	3401823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6137	NC_013851	CA	3	6	3402925	3402930	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6138	NC_013851	GCG	2	6	3410792	3410797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6146	NC_013851	TCG	2	6	3417530	3417535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6157	NC_013851	CAA	2	6	3422426	3422431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6173	NC_013851	AAGAA	2	10	3429785	3429794	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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6194	NC_013851	CCGA	2	8	3435228	3435235	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6231	NC_013851	CGC	2	6	3470622	3470627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6232	NC_013851	TGT	2	6	3470631	3470636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6252	NC_013851	CGAA	2	8	3488355	3488362	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6253	NC_013851	CTAAC	2	10	3489317	3489326	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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6255	NC_013851	ATCC	2	8	3489429	3489436	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6256	NC_013851	ACC	3	9	3489468	3489476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6257	NC_013851	ATC	2	6	3489490	3489495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6260	NC_013851	TCG	2	6	3495904	3495909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6261	NC_013851	GTC	2	6	3497784	3497789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6262	NC_013851	GATCC	2	10	3497805	3497814	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6263	NC_013851	AGTCAG	2	12	3504142	3504153	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6264	NC_013851	TGCT	2	8	3504154	3504161	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6265	NC_013851	GAT	2	6	3507290	3507295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6266	NC_013851	ATTC	2	8	3507404	3507411	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6267	NC_013851	CATGG	2	10	3507425	3507434	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6268	NC_013851	TGGA	2	8	3508011	3508018	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6269	NC_013851	TGGAT	2	10	3508040	3508049	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6270	NC_013851	A	6	6	3508579	3508584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6271	NC_013851	CCG	2	6	3508617	3508622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6272	NC_013851	TCA	2	6	3510215	3510220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6273	NC_013851	CGCT	2	8	3510225	3510232	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6274	NC_013851	TCGGA	2	10	3512631	3512640	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6275	NC_013851	CGC	2	6	3512667	3512672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6276	NC_013851	GCC	2	6	3512712	3512717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6277	NC_013851	CAG	2	6	3512735	3512740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6278	NC_013851	CGTCCC	2	12	3512788	3512799	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
6279	NC_013851	G	6	6	3516588	3516593	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6280	NC_013851	GAT	2	6	3516595	3516600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6281	NC_013851	CGC	2	6	3516712	3516717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6282	NC_013851	GT	3	6	3520292	3520297	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6283	NC_013851	GAT	2	6	3522315	3522320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6284	NC_013851	TCG	2	6	3522364	3522369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6285	NC_013851	TCA	2	6	3522419	3522424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6286	NC_013851	GCG	2	6	3524441	3524446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6287	NC_013851	CGC	2	6	3524447	3524452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6288	NC_013851	GGT	2	6	3526872	3526877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6289	NC_013851	TGA	2	6	3526889	3526894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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